在计算生物学和生物信息学领域，机器学习技术正迅速改变着我们对生物系统的研究方式。然而，随着模型复杂度的增加，如何解释这些模型的行为并从中提取生物学意义，成为了一个亟待解决的问题。 ...

近年来，大语言模型（LLMs）在自然语言处理领域取得了巨大进展，极大地提升了人机交互的效率和精准度。而在计算生物学中，蛋白质序列被类比为自然语言，基于此的蛋白质大语言模型（PLLMs）也应...

下面是一些开源的深度学习与大语言模型教程书籍，可以从 GitHub 免费下载。 神经网络与深度学习 链接： **https://nndl.github.io/ 介绍： 系统地整理了神经网络和深度学习的知识体系。鉴于深度...

如果因为网络问题无法下载安装 Docker，无法使用 DockerHub 镜像，可以使用下面的方法解决。 第三方 Docker 安装镜像 使用脚本镜像一键安装 Docker： sudo curl -fsSL https://gitee.com/tech-s...

新西兰奥塔哥大学高级讲师（Senior Lecturer ） Paul P. Gardner 在 bioRxiv 上发表了一篇名为《A Bioinformatician, Computer Scientist, and Geneticist lead bioinformatic tool development...

在Ubuntu上挂载一个未分区的硬盘需要几个步骤，包括分区、格式化和挂载。以下是详细的操作步骤： 1. 确认硬盘 首先，需要确认未分区的硬盘设备名。可以使用以下命令列出所有硬盘和分区： sudo f...

在 Ubuntu 中，可以使用以下步骤来查询和持久化挂载硬盘： 查询硬盘信息 使用 lsblk 命令： lsblk 命令会列出所有的块设备（包括硬盘、分区等）： lsblk 使用 fdisk 命令： fdisk 命令可以显示...

背景 血缘系数、亲缘系数、近交系数等表征亲缘关系的统计量，在遗传学中经常使用。然而，这些概念很容易混淆。下面是几个概念的区别。注意的是，这些名词大多由英文翻译而来，而不同地方的中文...

通过脚本从 stable channel 自动安装稳定版： curl -fsSL https://get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 也可以选择 test channel 安装预发布版本（alpha, beta, rc）等： curl -f...

多模态蛋白质语言模型是一个新兴的方向。 《Multi-scale Protein Language Model for Unified Molecular Modeling》是一篇发表在ICML 2024的文献，作者是 Kangjie Zheng、Siyu Long、Tianyu Lu...

BioCLIP 是一个利用图像和结构化生物知识回答生物学问题的多模态大模型。通过在生命之树（生物学分类）上训练模型，增强了对自然界层次结构的理解，具有强大的可泛化性。文章还创建了 TreeOfLif...

在生物医学和生物信息学领域，PRC 和 AUPRC 有着非常广泛的应用。然而，常用的计算工具本身存在的问题可能会被研究人员忽略，从而可能导致对结果解读的偏差。2024 年 5 月，香港中文大学曹沁研...