在PBS任务递交系统的 HPC 集群上，我们需要在登录节点上用 qsub 命令递交任务，把计算任务投递到计算节点中运算。如果你想在集群上使用 Jupyter Lab 或者 Jupyter Notebook，该怎么办？ 思路其...

用 R 画图的时候，如果 y 轴存在个别非常大或非常小的值，或者当中的数值存在非常大差异的时候，画出的图很容易产生误导效果，使人忽略当中某一部分信息。 比如，下面这张 GWAS 曼哈顿图中（来...

R 的 read.table 和 read.csv 读取文件速度比较慢。尤其在读取稍微大一点的数据，需要等很长时间。 在需要读取大文件时，尤其读取列数特别多的文件，不妨试试 data.table 包（https://cran.r-pr...

在国内连接 Anaconda 官方源速度非常慢。用官方源去安装、升级包，速度估计会抓狂，说不定还总是失败。 解决方法很简单，只需要把官方镜像替换为国内的镜像。网上搜的教程一般是清华或者中科大...

计算机明明还有空闲资源，但 Python 创建大量线程时，遇上OpenBLAS blas_thread_init报错怎么办？ 具体看看着报错信息： OpenBLAS blas_thread_init: RLIMIT_NPROC 4096 current, 8251551 max O...

做生信分析的人越来越多，但并不是每个人都有足够的计算资源。云计算是个好东西，但它的成本优势更多体现在大数据处理上，每天需要处理几十几百 TB 甚至 PB 级别的数据时，云计算才会比自建维护...

什么是 JIT Python 是门多才多艺的语言，既可以写后端，也可以做数据分析，既可以智能化运维，也可以搞渗透，既可以写爬虫，又可以做机器学习深度学习。然而，Python 的缺点也很明显，它的速度...

开篇三问 Q：有什么需求？ A：跑耗资源的科学运算。 Q：为什么捡垃圾？ A：因为穷。 Q：怎么捡垃圾？ A：全能的淘宝。 三个开篇问题，算是写这篇剁手文章的借口理由。普通 PC 很难支撑得起耗费...

一般情况下，R 的安装非常容易。但如果是在linux服务器上，而又没有root权限，安装就比较麻烦了。最直接的方法是自己在有读写权限的目录中编译安装，但过程非常繁琐，需要解决非常多依赖库，整...