基因组共5篇

Science|持续数十年的实验,通过细菌研究突变在演化过程的适应性效应-实验盒

Science|持续数十年的实验,通过细菌研究突变在演化过程的适应性效应

突变对生物体适应度(fitness,生存和繁殖的能力)的影响,可能会受到后续突变的影响,这可能会限制未来的适应性进化路径。这些变化如何发生、会产生怎样的影响,尚缺乏具体的数据。近日,《Sci...
4月9日 11:23
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[文章分享] Biobank测序时代的罕见变异关联分析进展综述-实验盒

[文章分享] Biobank测序时代的罕见变异关联分析进展综述

「文献题目」 Recent advances and challenges of rare variant association analysis in the biobank sequencing era 「中文标题」 生物样本库测序时代罕见变异关联分析的最新进展和挑战 「期...
3月23日 13:05
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依据SNP染色体和位置信息批量转换rs编号-实验盒

依据SNP染色体和位置信息批量转换rs编号

如果只有SNP的染色体和物理位置信息,该如何批量转换得到 rs ID? 思路非常简单,只需要下载 dbSNP 的参考文件,根据位置信息从参考文件中获取对应的 rs 编号即可。 下面列举两个例子。 重命名 ...
9月14日 11:31
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基于RAINBOW的单倍型全基因组关联分析(haplotype-based GWAS)教程-实验盒

基于RAINBOW的单倍型全基因组关联分析(haplotype-based GWAS)教程

听起来难以置信,单倍型关联分析竟然这么简单 Haplotype-based GWAS(单倍型全基因组关联分析)是基于 haplotype (单倍型)进行的关联分析,在基因组层面寻找与表型相关的变异。 Haplotype 是...
1月24日 20:22
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GWAS_Flow:使用GPU加速大规模数据的全基因组关联分析-实验盒

GWAS_Flow:使用GPU加速大规模数据的全基因组关联分析

21世纪是生物的世纪,生物数据的增长速度越来越快。很多分析工具在开发时并没有考虑到大规模数据的应用场景。在数据量不大的时候,这些工具的计算时间并不会太长,可以让人接受。但在数据规模庞...
6月20日 12:51
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